Wissenschaftler entschlüsseln Olivenbaumgenom

Ein Team von Wissenschaftlern aus Spanien hat erstmals das komplette Genom des Olivenbaums veröffentlicht.

Jun. 30, 2016
Von Isabel Putinja

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Forscher des Zentrums für Genomregulation (CRG), des Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) und des Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) entschlüsselten das Genom des Olivenbaums mithilfe eines 1,300 Jahre alten Exemplars der Spanier Farga-Sorte als Referenz.

In den letzten 10 Jahren wurde bei einigen Pflanzenarten der genetische Code zusammengestellt, kommentiert und öffentlich zugänglich gemacht. Jetzt kann der Olivenbaum zu dieser Liste der sequenzierten Pflanzengenome hinzugefügt werden. Das dreijährige Forschungsprojekt wurde von der spanischen Bank Banco Santander finanziert und am 27. Juni 2016 in GigaScience, einem Open-Data-Journal, veröffentlicht

Das Forschungsprojekt wurde von Pablo Vargas, einem Forscher des CSIC Real Jardín Botánico, koordiniert, der den Prozess in einer Pressemitteilung erläuterte:

"Die Genomsequenzierung besteht aus drei Phasen: Erstens: Isolieren Sie alle Gene, die wir vor zwei Jahren veröffentlicht haben. Zweitens stellen Sie das Genom zusammen, bei dem es darum geht, diese Gene nacheinander zu ordnen, wie wenn Sie lose Phrasen in einem Buch verknüpfen. Zuletzt identifizieren Sie alle Gene oder binden das Buch. Die letzten beiden Phasen haben wir getan und präsentieren sie jetzt. “

Pablo Vargas (CSIC)

Bei der Identifizierung der Gene des Olivenbaums stellten die Forscher fest, dass er über 56,000 Gene besitzt, viel mehr als andere Pflanzenarten und doppelt so viel wie das menschliche Genom.

Die Forscher haben auch herausgefunden, dass die Verwendung eines 1,300 Jahre alten Exemplars eines Olivenbaums das erste Mal war, dass ein solches Exemplar verwendet wurde "individual “wurde das Genom sequenziert. "Bisher haben alle sequenzierten Individuen, von der Fruchtfliege (Drosophila melanogaster) bis zum ersten analysierten Menschen, abhängig von ihrer begrenzten Lebenserwartung eine bestimmte Zeit gelebt. Dies ist das erste Mal, dass die DNA eines über 1,000 Jahre alten Individuums, das wahrscheinlich noch 1,300 Jahre alt sein wird, sequenziert wurde “, enthüllten die Forscher Pablo Vargas und Toni Gabaldón (CRG).

Das Verständnis des genetischen Codes des Olivenbaums hilft Wissenschaftlern, eine Vielzahl von Faktoren zu verstehen, die mit dem Baum zusammenhängen, einschließlich seiner Langlebigkeit, seiner Anpassungsfähigkeit an trockene Bedingungen und der Unterschiede zwischen den Sorten, Größen und dem Geschmack von Oliven. Letztendlich wird dies auch neue Forschungen zur genetischen Verbesserung der Produktion von Oliven und Olivenöl sowie zum Schutz des Olivenbaums vor Bakterien und Infektionen ermöglichen.

Um die weitere Forschung zu erleichtern, wurde die vollständige Sequenzierung des Olivenbaumgenoms auf GigaScience öffentlich zugänglich gemacht GigaDB-Datenbank.


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