Wissenschaftler entschlüsseln das Genom des Olivenbaums
Ein Team von Wissenschaftlern aus Spanien hat erstmals das vollständige Genom des Olivenbaums veröffentlicht.
Forscher des Zentrums für Genomregulierung (CRG), dem Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) und dem Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) haben das Genom des Olivenbaums entschlüsselt, wobei sie ein 1.300 Jahre altes Exemplar der spanischen Sorte Farga als Referenz verwendeten.
In den letzten 10 Jahren wurde der genetische Code einer Reihe von Pflanzenarten entschlüsselt, annotiert und öffentlich zugänglich gemacht. Nun kann auch der Olivenbaum in diese Liste der sequenzierten Pflanzengenome aufgenommen werden. Das dreijährige Forschungsprojekt wurde von der spanischen Bank Banco Santander finanziert und am 27. Juni 2016 in GigaScience, einer Open-Data-Zeitschrift, veröffentlicht
Das Forschungsprojekt wurde von Pablo Vargas, einem Forscher des CSIC Real Jardín Botánico, koordiniert, der den Prozess in einer Pressemitteilung erläuterte:
„Die Genomsequenzierung umfasst drei Phasen: Zunächst werden alle Gene isoliert, was wir vor zwei Jahren veröffentlicht haben. Zweitens wird das Genom zusammengesetzt, was bedeutet, diese Gene nacheinander zu ordnen, so als würde man lose Sätze in einem Buch miteinander verknüpfen. Zuletzt werden alle Gene identifiziert, also das Buch gebunden. Die beiden letztgenannten Phasen haben wir durchgeführt und präsentieren sie nun.“
Pablo Vargas (CSIC)
Während des Identifizierungsprozesses der Gene des Olivenbaums stellten die Forscher fest, dass er über 56.000 Gene besitzt, weit mehr als andere Pflanzenarten und doppelt so viele wie das menschliche Genom.
Die Forscher haben zudem aufgedeckt, dass durch die Verwendung eines 1.300 Jahre alten Exemplars eines Olivenbaums zum ersten Mal das Genom eines so alten „Individuums“ sequenziert wurde. „Bislang haben alle sequenzierten Individuen, von der Fruchtfliege (Drosophila melanogaster) bis zum ersten analysierten Menschen, eine bestimmte Zeit gelebt, abhängig von ihrer begrenzten Lebenserwartung. Dies ist das erste Mal, dass die DNA eines Individuums sequenziert wurde, das über 1.000 Jahre alt ist und wahrscheinlich noch weitere 1.300 Jahre leben wird“, erklärten die Forscher Pablo Vargas und Toni Gabaldón (CRG).
Das Verständnis des genetischen Codes des Olivenbaums wird Wissenschaftlern helfen, eine Vielzahl von Faktoren im Zusammenhang mit dem Baum zu verstehen, darunter seine Langlebigkeit, seine Anpassungsfähigkeit an trockene Bedingungen sowie Unterschiede zwischen den Sorten, Größen und Geschmacksrichtungen der Oliven. Letztendlich wird dies auch neue Forschungen zur genetischen Verbesserung für die Produktion von Oliven und Olivenöl sowie zum Schutz des Olivenbaums vor Bakterien und Infektionen ermöglichen.
Um weitere Forschungen zu ermöglichen, wurde die vollständige Sequenzierung des Olivenbaum-Genoms in der GigaScience GigaDB-Datenbank öffentlich zugänglich gemacht.