Konstantinos Blazakis (à gauche) avec des collègues du laboratoire de l'Institut agronomique méditerranéen de La Canée (MAICh) en Crète, en Grèce; (Photo par Lisa Radinovsky)

Une nouvelle méthodologie semi-automatique d'identification des cultivars d'olives en fonction de l'apparence des feuilles et des fruits devrait servir de base à une application téléphonique pour les producteurs et à des contributions à une nouvelle base de données internationale sur les oliviers, selon Konstantinos Blazakis, chercheur travaillant avec Panagiotis Kalaitzis du Département de génétique horticole et de biotechnologie de l'Institut agronomique méditerranéen de La Canée (MAICh) en Crète, en Grèce.

Blazakis espère qu'une application de cette nouvelle méthode sera une application pour téléphone portable qui permettra d'identifier le cultivar sur la base d'une photo d'un fruit, d'une feuille ou d'un endocarpe. Il espère commencer avec les cultivars grecs d'ici un an ou deux et espère obtenir un soutien pour ajouter ultérieurement des cultivars internationaux à cette application. Il admet que l'application de téléphonie mobile sera probablement plus utile dans les pays où il existe de nombreuses variétés d'olives, car les agriculteurs veulent être sûrs de connaître leur cultivar.

Un autre objectif de Blazakis est de contribuer à une nouvelle base de données internationale en ligne qui répertoriera des informations sur l'apparence et l'analyse chimique, entre autres, des variétés d'olives dans le monde. Il a déclaré que quinze partenaires de plusieurs pays travaillaient ensemble à la préparation de cette base de données conviviale destinée au grand public, qui sera "basée sur l'étude génétique, physiologique, moléculaire et morphologique de chaque cultivar". données précédentes, double vérification de l'exactitude, ainsi que l'ajout de nouvelles informations.

Cela fait partie du projet ambitieux et de grande envergure Bioresources For Oliviculture, ou BeFOre, qui a reçu un financement de l'Union européenne. Horizon 2020 programme de recherche et d’innovation dans le cadre de la convention de subvention Marie Skłodowska-Curie et bénéficie également du soutien du Conseil oléicole international.

BeFOre est «centré sur l’établissement de protocoles communs intégrés pour le phénotype et la caractérisation des plantes aux niveaux moléculaire, morphologique et physiologique, et sur l’évaluation de la qualité de l’huile d’olive liée aux variétés», selon ses principes. website, "S'attendant à améliorer le potentiel des collections, du référentiel et des banques de matériel génétique d'olive en tant que sources principales de variabilité et d'outils d'évaluation à utiliser pour accroître la durabilité de l'oliviculture et pour faire face aux problèmes existants et futurs".

Konstantinos Blazakis (Lisa Radinovsky)

Blazakis insiste sur l'importance d'évaluer et de caractériser la diversité des espèces d'oliviers afin de préserver la riche variété de ressources génétiques, ainsi que sur leurs avantages pour la santé. Il se concentre sur la forme et la structure, ou morphologie, des olives, des oliviers et de leurs feuilles.

Blazakis a présenté son travail en collaboration avec Luciana Baldoni et Marina Bufacchi du Conseil national de la recherche italien, Abdelmajid Moukhli de l'INRA Marrakech au Maroc et Panagiotis lors du 3ème Symposium international sur l'horticulture en Europe, à Crète, en Crète. Kalaitzis de MAICh (qui fait partie du Centre international de hautes études agronomiques méditerranéennes).

Dans une présentation intitulée «Algorithmes mathématiques avancés pour caractériser les variétés d'olive à l'aide de paramètres morphologiques», M. Blazakis a expliqué que son «étude visait à présenter une toute nouvelle méthodologie semi-automatique pour la détection de divers paramètres morphologiques» de différents cultivars d'olivier. Sa méthode implique des étapes 5:

  • prélever des échantillons de feuilles et de fruits: 25 ou 30 au milieu d'un arbre dont la variété a été déterminée en pépinière
  • créer des données d'imagerie: prendre des photos d'eux
  • segmentation: séparez l'image des feuilles, des olives ou des graines de l'arrière-plan à l'aide d'un logiciel scientifique
  • appliquer des algorithmes mathématiques: utiliser le logiciel MATLAB pour créer un ensemble d'instructions relatives aux divers aspects de la forme et de la structure de l'olive ou de la feuille, par exemple (pour le fruit), périmètre, hauteur, largeur maximale, position de largeur maximale, symétrie ou absence de symétrie, forme d'ellipse, courbure, mamelon
  • traduire les résultats: vous obtenez des chiffres décrivant chaque aspect de la forme et de la structure de chaque cultivar d'olive

Blazakis a mentionné qu'il était nécessaire de faire plus de tests pour s'assurer que les paramètres morphologiques avec lesquels son équipe travaille pouvaient faire la distinction entre différents cultivars, mais il pensait qu'ils réussiraient. Il a ajouté que l'outil automatisé qu'il développait fournirait une méthode plus rapide et moins onéreuse pour déterminer un cultivar d'olive que l'analyse ADN et constituerait une option utile pour de nombreux agriculteurs qui recherchent des informations sur leurs arbres.



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