Europe

Nouvelle méthode d'identification des cultivars d'olives

L’identification des cultivars d’oliviers en fonction de l’apparence des feuilles et des fruits devrait servir de base à une application téléphonique et à des contributions à une nouvelle base de données internationale sur les oliviers.

4 novembre 2016
Par Lisa Radinovsky

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Selon Konstantinos Blazakis, chercheur travaillant avec Panagiotis Kalaitzis au Département de génétique horticole et de biotechnologie de l'Institut agronomique méditerranéen de La Canée (MAICh) en Crète, Grèce.

Blazakis espère qu'une application de cette nouvelle méthode sera une application pour téléphone portable qui sera en mesure d'identifier le cultivar sur la base d'une photo d'un fruit d'olivier, d'une feuille ou d'un endocarpe. Il prévoit de commencer avec des cultivars grecs dans un an ou deux et espère obtenir un soutien pour ajouter des cultivars internationaux à cette application en tant que projet supplémentaire plus tard. Il admet que l'application pour téléphone portable sera probablement la plus utile dans les pays où il existe de nombreuses variétés d'olives différentes, car les agriculteurs veulent être sûrs de savoir quel cultivar ils ont.

Un autre des objectifs de Blazakis est de contribuer à une nouvelle base de données internationale en ligne qui répertoriera des informations sur l'apparence et l'analyse chimique, entre autres, des variétés d'olives du monde entier. Il a déclaré que quinze partenaires d'un certain nombre de pays travaillent ensemble pour préparer cette base de données conviviale pour le grand public, qui sera "sur la base de l'étude génétique, physiologique, moléculaire et morphologique de chaque cultivar.

Cela fait partie du vaste et ambitieux projet Bioresources For Oliviculture, ou BeFOre, qui a reçu un financement de l'Union européenne. Horizon 2020 programme de recherche et d'innovation dans le cadre de la convention de subvention Marie Skłodowska-Curie et est également soutenu par le Conseil oléicole international.

BeFOre est "concentré sur l’établissement de protocoles communs intégrés pour phénotyper et caractériser les plantes au niveau moléculaire, morphologique et physiologique, et évaluer la qualité de l’huile d’olive liée aux variétés », site Internet, "espérant améliorer le potentiel des collections, des dépôts et des banques de ressources génétiques d'olive en tant que principales sources de variabilité et d'outils d'évaluation à utiliser pour accroître la durabilité de l'oliviculture et faire face aux problèmes existants et futurs.

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Konstantinos Blazakis (Lisa Radinovsky)

Soulignant l'importance d'évaluer et de caractériser la diversité des espèces d'olives afin de préserver la riche variété des ressources génétiques avec tous leurs avantages pour la santé, Blazakis se concentre sur la forme et la structure, ou la morphologie, des olives, des oliviers et de leurs feuilles.

Au 3rd Symposium international sur l'horticulture en Europe à La Canée, en Crète à la mi-octobre, Blazakis a présenté le travail qu'il effectue en collaboration avec Luciana Baldoni et Marina Bufacchi du Conseil national italien de la recherche, Abdelmajid Moukhli de l'INRA de Marrakech au Maroc et Panagiotis Kalaitzis du MAICh (qui fait partie du Centre international des hautes études agronomiques méditerranéennes).

Dans une présentation intitulée "Algorithmes mathématiques avancés pour caractériser les variétés d'olive à travers des paramètres morphologiques », a expliqué Blazakis. "Cette étude vise à présenter une toute nouvelle méthodologie semi-automatique pour détecter divers paramètres morphologiques »de différents cultivars d'oliviers. Sa méthode comporte 5 étapes:

  • recueillir des échantillons de feuilles et de fruits: 25 ou 30 au milieu d'un arbre dont la variété a été déterminée en pépinière
  • créer des données d'imagerie: prendre des photos d'eux
  • segmentation: séparez l'image des feuilles, des olives ou des graines de l'arrière-plan à l'aide d'un logiciel scientifique
  • appliquer des algorithmes mathématiques: utiliser le logiciel MATLAB pour créer un ensemble d'instructions liées à divers aspects de la forme et de la structure de l'olive ou de la feuille, par exemple (pour le fruit) surface, périmètre, hauteur, largeur maximale, position de la largeur maximale, symétrie ou manque de symétrie, forme d'ellipse, courbure, mamelon
  • traduire les résultats: se retrouver avec des nombres qui décrivent chaque aspect de la forme et de la structure de chaque cultivar d'olive

Blazakis a mentionné qu'il est nécessaire d'effectuer plus de tests pour être sûr que les paramètres morphologiques avec lesquels son équipe travaille peuvent distinguer les différents cultivars, mais il pense qu'ils réussiront. Il a ajouté que l'outil automatisé qu'il développe fournira une méthode plus rapide et moins coûteuse pour déterminer un cultivar d'olive que l'analyse d'ADN et fournira une option utile pour de nombreux agriculteurs qui recherchent des informations sur leurs arbres.



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