Des scientifiques décodent le génome de l'olivier
Une équipe de scientifiques espagnols a publié pour la première fois le génome complet de l'olivier.
Des chercheurs du Centre de régulation génomique (CRG), du Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) et du Centre national d'analyse génomique (CNAG-CRG) ont décodé le génome de l'olivier en utilisant comme référence un spécimen vieux de 1 300 ans appartenant à la variété espagnole Farga.
Au cours des dix dernières années, le code génétique d'un certain nombre d'espèces végétales a été séquencé, annoté et rendu accessible au public. L'olivier peut désormais être ajouté à cette liste de génomes végétaux séquencés. Ce projet de recherche, d'une durée de trois ans, a été financé par la banque espagnole Banco Santander et publié le 27 juin 2016 dans GigaScience, une revue en libre accès
Le projet de recherche a été coordonné par Pablo Vargas, chercheur au CSIC Real Jardín Botánico, qui a expliqué le processus dans un communiqué de presse :
« Le séquençage du génome comporte trois phases : premièrement, isoler tous les gènes, ce que nous avons publié il y a deux ans. Deuxièmement, assembler le génome, ce qui consiste à ordonner ces gènes les uns après les autres, comme on relie des phrases éparses dans un livre. Enfin, identifier tous les gènes, ou relier le livre. Ce sont ces deux dernières phases que nous avons réalisées et que nous présentons aujourd’hui. »
Pablo Vargas (CSIC)
Au cours du processus d’identification des gènes de l’olivier, les chercheurs ont découvert qu’il en comptait plus de 56 000, bien plus que d’autres espèces végétales, et le double du génome humain.
Les chercheurs ont également révélé qu’en utilisant un spécimen d’olivier vieux de 1 300 ans, c’était la première fois qu’un « individu » aussi ancien voyait son génome séquencé. « Jusqu’à présent, tous les individus séquencés, de la mouche du vinaigre (Drosophila melanogaster) au premier être humain analysé, ont vécu pendant un certain temps, en fonction de leur espérance de vie limitée. C'est la première fois que l'ADN d'un individu âgé de plus de 1 000 ans, et qui vivra probablement encore 1 300 ans, a été séquencé », ont révélé les chercheurs Pablo Vargas et Toni Gabaldón (CRG).
La compréhension du code génétique de l’olivier aidera les scientifiques à appréhender divers facteurs liés à cet arbre, notamment sa longévité, son adaptabilité aux conditions arides, ainsi que les différences entre les variétés, les tailles et la saveur des olives. À terme, cela facilitera également de nouvelles recherches sur l’amélioration génétique pour la production d’olives et d’huile d’olive, ainsi que sur la manière de protéger l’olivier contre les bactéries et les infections.
Afin de faciliter la poursuite des recherches, le séquençage complet du génome de l’olivier a été mis à la disposition du public dans la base de données GigaDB de GigaScience.