Gli scienziati decodificano il genoma dell'olivo

I ricercatori del Center for Genomic Regulation (CRG), del Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) e del Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) hanno decodificato il genoma dell'olivo utilizzando un campione di 1,300 anni appartenente allo spagnolo Varietà Farga come riferimento.

Negli ultimi 10 anni, un certo numero di specie vegetali ha ottenuto il loro codice genetico assemblato, annotato e reso pubblicamente disponibile. Ora l'olivo può essere aggiunto a questo elenco di genomi vegetali sequenziati. Il progetto di ricerca triennale è stato finanziato dalla banca spagnola Banco Santander e pubblicato il 27 giugno 2016 su GigaScience, una rivista di dati aperti

Il progetto di ricerca è stato coordinato da Pablo Vargas, un ricercatore del CSIC Real Jardín Botánico, che ha spiegato il processo in un comunicato stampa:

"Ci sono tre fasi per il sequenziamento del genoma: primo, isolare tutti i geni, che abbiamo pubblicato due anni fa. In secondo luogo, assemblare il genoma, che è questione di ordinare quei geni uno dopo l'altro, come collegare frasi sciolte in un libro. Infine, identifica tutti i geni o rilegare il libro. Le ultime due fasi sono ciò che abbiamo fatto e che stiamo presentando ".

Durante il processo di identificazione dei geni dell'olivo, i ricercatori hanno scoperto che aveva oltre i geni 56,000, molto più di altre specie vegetali, e il doppio di quello del genoma umano.

I ricercatori hanno anche rivelato che utilizzando un esemplare di ulivo di 1,300 anni fa, questa era la prima volta che un "individual "ha avuto il suo genoma sequenziato. "Fino ad ora tutti gli individui sequenziati, dal moscerino della frutta (Drosophila melanogaster) al primo essere umano analizzato, hanno vissuto per un certo tempo, a seconda della loro limitata aspettativa di vita. Questa è la prima volta che viene sequenziato il DNA di un individuo di oltre 1,000 anni, e che probabilmente vivrà altri 1,300 anni ”, hanno rivelato i ricercatori Pablo Vargas e Toni Gabaldón (CRG).

Comprendere il codice genetico dell'olivo aiuterà gli scienziati a comprendere una varietà di fattori legati all'albero, tra cui la sua longevità, la sua adattabilità alle condizioni aride e le differenze tra le varietà, le dimensioni e il sapore delle olive. In definitiva, ciò faciliterà anche la nuova ricerca sul miglioramento genetico per la produzione di olive e olio d'oliva e su come proteggere l'olivo da batteri e infezioni.

Al fine di facilitare ulteriori ricerche, il sequenziamento completo del genoma dell'olivo è stato reso di dominio pubblico su GigaScience Database GigaDB.

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