Gli scienziati decodificano il genoma dell'olivo
Un gruppo di scienziati spagnoli ha pubblicato per la prima volta il genoma completo dell'olivo.
I ricercatori del Centro per la Regolazione Genomica (CRG), del Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) e del Centro Nazionale di Analisi Genomica (CNAG-CRG) hanno decodificato il genoma dell'olivo utilizzando come riferimento un esemplare di 1.300 anni appartenente alla varietà spagnola Farga.
Negli ultimi 10 anni, il codice genetico di numerose specie vegetali è stato assemblato, annotato e reso disponibile al pubblico. Ora l'olivo può essere aggiunto a questo elenco di genomi vegetali sequenziati. Il progetto di ricerca triennale è stato finanziato dalla banca spagnola Banco Santander e pubblicato il 27 giugno 2016 su GigaScience, una rivista open-access
Il progetto di ricerca è stato coordinato da Pablo Vargas, ricercatore del CSIC Real Jardín Botánico, che ha spiegato il processo in un comunicato stampa:
“Il sequenziamento del genoma prevede tre fasi: in primo luogo, isolare tutti i geni, cosa che abbiamo pubblicato due anni fa. In secondo luogo, assemblare il genoma, il che significa ordinare quei geni uno dopo l’altro, come se si collegassero frasi sparse in un libro. Infine, identificare tutti i geni, ovvero rilegare il libro. Le ultime due fasi sono quelle che abbiamo completato e che ora presentiamo.”
Pablo Vargas (CSIC)
Durante il processo di identificazione dei geni dell’olivo, i ricercatori hanno scoperto che ne possedeva oltre 56.000, molti più di altre specie vegetali e il doppio rispetto al genoma umano.
I ricercatori hanno inoltre rivelato che, utilizzando un esemplare di olivo di 1.300 anni, questa è stata la prima volta in cui è stato sequenziato il genoma di un “individuo” così antico. “Fino ad ora, tutti gli individui sequenziati, dal moscerino della frutta (Drosophila melanogaster) al primo essere umano analizzato, hanno vissuto per un certo periodo, a seconda della loro limitata aspettativa di vita. È la prima volta che viene sequenziato il DNA di un individuo che ha più di 1.000 anni e che probabilmente vivrà altri 1.300 anni”, hanno rivelato i ricercatori Pablo Vargas e Toni Gabaldón (CRG).
Comprendere il codice genetico dell’olivo aiuterà gli scienziati a comprendere una serie di fattori relativi all’albero, tra cui la sua longevità, la sua adattabilità alle condizioni aride e le differenze tra le varietà, le dimensioni e il sapore delle olive. In definitiva, ciò faciliterà anche nuove ricerche sul miglioramento genetico per la produzione di olive e olio d’oliva e su come proteggere l’olivo da batteri e infezioni.
Al fine di facilitare ulteriori ricerche, il sequenziamento completo del genoma dell’olivo è stato reso disponibile nel dominio pubblico sul database GigaDB di GigaScience.