科学者らがオリーブのゲノムを解読

スペインの科学者チームが、オリーブの全ゲノム配列を初めて公表した。

ゲノム規制センター(CRG)、レアル・ハルディン・ボタニコ(CSIC-RJB)、および国立ゲノム解析センター(CNAG-CRG)の研究者らは、スペインの「ファルガ」品種に属する樹齢1,300年の標本を参照として用い、オリーブのゲノム解読に成功した。

過去10年間で、数多くの植物種の遺伝情報が解読、注釈付けされ、一般に公開されてきた。今回、オリーブの木もこの解読済み植物ゲノムリストに加わることとなった。この3年間にわたる研究プロジェクトは、スペインの銀行バンコ・サンタンデール(Banco Santander)の資金提供を受けて実施され、2016年6月27日にオープンアクセス誌『GigaScience』に掲載された。

この研究プロジェクトは、CSICレアル・ハルディン・ボタニコの研究者パブロ・バルガスが統括し、彼はプレスリリースでそのプロセスを次のように説明した:

「ゲノム解読には3つの段階があります。第一に、すべての遺伝子を単離することです。これは2年前に発表済みです。第二に、ゲノムを組み立てることです。これは、本の中のバラバラな文章をつなぎ合わせるように、それらの遺伝子を順番に並べる作業です。最後に、すべての遺伝子を同定すること、つまり本を製本することです。私たちが実施し、今回発表するのは、この最後の2つの段階です。」

パブロ・バルガス(CSIC)

パブロ・バルガス(CSIC)

オリーブの木の遺伝子同定プロセスにおいて、研究者らは、この木が56,000個以上の遺伝子を持っていることを発見した。これは他の植物種よりもはるかに多く、ヒトゲノムの2倍に相当する。

また研究者らは、樹齢1,300年のオリーブの標本を用いたことで、これほど古い「個体」のゲノムが解読されたのは今回が初めてであることを明らかにした。「これまで、ショウジョウバエ(Drosophila melanogaster)から最初に解析されたヒトに至るまで、解読されたすべての個体は、その限られた寿命に応じて一定期間生きてきたものです。 樹齢1,000年を超え、おそらくあと1,300年は生き続けると見られる個体のDNAが解読されたのは、これが初めてです」と、研究者のパブロ・バルガス氏とトニ・ガバルドン氏(CRG)は明らかにした。

オリーブの木(Olea europaea)の遺伝コードを解明することは、その長寿、乾燥環境への適応力、品種の差異、果実の大きさや風味など、この木に関連する様々な要因を理解する上で科学者たちの助けとなる。最終的には、オリーブやオリーブオイルの生産に向けた品種改良や、細菌や感染症からオリーブの木を守る方法に関する新たな研究も促進されるだろう。

今後の研究を促進するため、オリーブのゲノム全解読データは、GigaScienceのGigaDBデータベースにて公開されています。