Bilim adamları zeytin ağacı genomunu çözer

İspanya'dan bir bilim adamları ekibi ilk kez zeytin ağacının bütün genomunu yayınladılar.

Isabel Putinja adlı geliştiriciden
30 Haziran 2016 07:43 UTC
363

Genomik Düzenleme Merkezi'nden (CRG), Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) ve Centro Nacional de Análisis Genómico'dan (CNAG-CRG) araştırmacılar, İspanyollara ait 1,300 yıllık bir örneği kullanarak zeytin ağacı genomunu çözdüler. Referans olarak Farga çeşidi.

Geçtiğimiz 10 yıl içinde, bir dizi bitki türünün genetik kodları bir araya getirildi, açıklandı ve halka açık hale getirildi. Şimdi zeytin ağacı bu sıralı bitki genomları listesine eklenebilir. Üç yıllık araştırma projesi İspanyol bankası Banco Santander tarafından finanse edildi ve 27 Haziran 2016'da açık veri dergisi GigaScience'da yayınlandı.

Araştırma projesi, CSIC Real Jardín Botánico'dan bir araştırmacı olan ve süreci bir haber bülteninde açıklayan Pablo Vargas tarafından koordine edildi:

"Genom dizilemesinin üç aşaması vardır: birincisi, iki yıl önce yayınladığımız tüm genleri izole edin. İkincisi, bir kitaptaki gevşek cümleleri birbirine bağlamak gibi, bu genleri birbiri ardına sıralamakla ilgili olan genomu bir araya getirin. Son olarak, tüm genleri tanımlayın veya kitabı bağlayın. Son iki aşama yaptığımız ve şimdi sunduğumuz şeydir. "

Pablo Vargas (CSIC)

Zeytin ağacının genlerinin tanımlanması sürecinde araştırmacılar, 56,000 genlerinin üzerinde, diğer bitki türlerinden çok daha fazla olduğunu ve insan genomunun iki katına sahip olduğunu keşfetti.

Araştırmacılar ayrıca, 1,300 yıllık bir zeytin ağacı örneğini kullanarak, bu kadar yaşlı bir zeytin ağacının ilk kez olduğunu ortaya çıkardılar. "Birey ”in genomu sıralanmıştır. "Şimdiye kadar, meyve sineğinden (Drosophila melanogaster) analiz edilen ilk insana kadar sekanslanan tüm bireyler, sınırlı yaşam beklentilerine bağlı olarak belirli bir süre yaşadılar. Araştırmacılar Pablo Vargas ve Toni Gabaldón (CRG), 1,000 yaşın üzerindeki ve muhtemelen 1,300 yıl daha yaşayacak olan bir bireyin DNA'sının ilk kez sıralandığını ortaya koydu.

Zeytin ağacının genetik kodunu anlamak, bilim insanlarının uzun ömürlülüğü, kurak koşullara uyarlanabilirliği ve zeytin çeşitleri, boyutları ve lezzetleri arasındaki farklılıklar dahil olmak üzere ağaçla ilgili çeşitli faktörleri anlamalarına yardımcı olacaktır. Sonuç olarak, bu aynı zamanda zeytin ve zeytinyağı üretimi için genetik iyileştirme ve zeytin ağacının bakteri ve enfeksiyonlardan nasıl korunacağına dair yeni araştırmaları da kolaylaştıracaktır.

Daha fazla araştırmayı kolaylaştırmak için, zeytin ağacı genomunun tam dizilimi kamuya açık alanda GigaScience’ta kullanıma sunulmuştur. GigaDB veritabanı.


reklâm
reklâm

İlgili Makaleler