科学家破译橄榄树基因组
一支来自西班牙的科学家团队首次公布了橄榄树的完整基因组。
来自基因组调控中心(CRG)、 皇家植物园(CSIC-RJB)以及国家基因组分析中心(CNAG-CRG)的研究人员,以一株拥有1300年树龄的西班牙法尔加(Farga)品种橄榄树为参考,成功破译了橄榄树的基因组。
在过去的10年里,已有多种植物物种完成了基因组测序、注释并向公众开放。 如今,橄榄树也加入了这一已测序植物基因组名单。这项为期三年的研究项目由西班牙桑坦德银行资助,并于2016年6月27日发表在开放数据期刊《GigaScience》上
该项目由西班牙国家研究委员会皇家植物园的研究员帕布罗·巴尔加斯(Pablo Vargas)负责协调,他在一份新闻稿中解释了这一过程:
“基因组测序分为三个阶段:首先是分离所有基因,这项工作我们两年前已发表;其次是组装基因组,即把这些基因按顺序排列,就像把书中零散的句子串联起来一样。 最后,鉴定所有基因,即装订成书。后两个阶段正是我们已完成并即将展示的内容。”

巴勃罗·巴尔加斯(CSIC)
在橄榄树基因鉴定过程中,研究人员发现其拥有超过56,000个基因,远多于其他植物物种,且是人类基因组的两倍。
研究人员还指出,通过使用一株树龄达1300年的橄榄树样本,这是首次对如此古老的“个体”进行基因组测序。 “迄今为止,从果蝇(Drosophila melanogaster)到首个被分析的人类,所有被测序的个体都已存活了一段时间,具体时长取决于它们有限的寿命。 这是首次对一棵树龄超过1000年、且可能再存活1300年的个体进行DNA测序,”CRG的研究人员Pablo Vargas和Toni Gabaldón透露道。
了解橄榄树的基因密码将有助于科学家理解与该树种相关的各种因素,包括其长寿特性、对干旱环境的适应能力,以及橄榄品种、大小和风味之间的差异。 最终,这也将促进针对橄榄和橄榄油生产的新育种研究,以及如何保护橄榄树免受细菌和感染的研究。
为了促进进一步的研究,橄榄树基因组的完整测序数据已通过GigaScience GigaDB数据库向公众开放。