Des chercheurs identifient des gènes de l'olivier associés au poids des fruits
Ces résultats pourraient aider les producteurs à sélectionner les variétés d'oliviers les plus productives. Dans un deuxième temps, ils prévoient de rechercher les gènes associés à la production de polyphénols.
Des chercheurs espagnols ont identifié neuf gènes qui, selon eux, présentaient une « corrélation statistiquement très significative » avec le poids des fruits.
Historiquement, le poids des fruits était le caractère le plus important recherché par les agriculteurs lorsqu’ils choisissaient les cultivars d’olivier sauvage à domestiquer, au même titre que la teneur en huile et la capacité à pousser dans des environnements anthropiques.
« Une taille de fruit plus importante est extrêmement importante chez les oliviers cultivatés pour faciliter la récolte », ont écrit des chercheurs de l’université de Jaén et de l’Institut de recherche et de formation en agriculture et pêche (Ifapa) dans l’étude publiée dans Plants.
Voir aussi : Des chercheurs s’efforcent d’inverser l’érosion génétique et de sélectionner des variétés d’oliviers résistantes« C’est pourquoi la taille des fruits des cultivars d’olivier traditionnels est bien plus grande que celle des variétés sauvages », ont-ils ajouté. « Cependant, comme la longue période de juvenilité constitue un obstacle majeur dans les approches de sélection classiques, l’obtention de marqueurs génétiques à utiliser dans les programmes de sélection pour ce caractère est un outil hautement souhaté. »
Selon les chercheurs, il s’agit de la première étude identifiant des gènes individuels liés au poids des olives. La Fondation Discover, un groupe de soutien à la recherche du gouvernement andalou qui a financé l’étude, a salué ces résultats comme une avancée significative dans la compréhension de la génétique du développement du fruit de l’olivier.
Les chercheurs ont utilisé les données issues des génomes de 40 variétés d’oliviers cultivés et de dix espèces d’oliviers sauvages, qu’ils avaient préalablement séquencés, en sélectionnant des échantillons représentatifs de chaque variété comprenant des olives de poids différents.
Ils ont déclaré que les 40 variétés d'olives cultivées représentaient plus de 90 % de la variabilité génétique des variétés d'oliviers domestiqués. Ils ont ajouté que les dix variétés sauvages séquencées représentaient un large échantillon géographique d'oliviers non domestiqués.
Les chercheurs ont extrait l'ADN des 50 spécimens à l'aide d'une analyse d'étude d'association pangénomique, qu'ils ont décrite comme similaire à la « lecture » et à l'assemblage de l'ADN, comme s'il s'agissait d'un manuel d'instructions détaillé.
Ce faisant, ils ont identifié 113 marqueurs génétiques regroupés en plusieurs clusters. Les chercheurs ont ensuite effectué une analyse statistique pour détecter les corrélations entre les clusters de marqueurs génétiques et les recoupements entre les échantillons d’olives.
Ils ont ainsi déterminé que 18 des 31 marqueurs regroupés en neuf clusters étaient liés à la taille et au poids des fruits, ce qui suggère que neuf gènes interviennent dans la détermination de la taille des fruits.
« L’analyse de marqueurs génétiques spécifiques, tels que ceux qui déterminent le poids de l’olive, facilite la sélection d’arbres présentant des caractéristiques bénéfiques, accélérant ainsi le processus d’amélioration génétique », a déclaré Francisco Luque, chercheur à l’université de Jaén et coauteur de l’étude. « C’est comme ouvrir un manuel pour chaque arbre qui nous indique ses qualités. »
« Par exemple, si l’on analyse un très jeune olivier et qu’une analyse génétique permet de conclure que le fruit aura un poids médiocre, on pourrait décider de l’écarter et de consacrer les ressources à un spécimen dont les marqueurs génétiques indiquent que l’olive pèsera plus lourd », a-t-il ajouté.
Les chercheurs prévoient désormais d’utiliser une méthode similaire pour identifier les marqueurs génétiques et les gènes qui influencent la production de polyphénols dans différentes variétés d’olives. Ils estiment que cela aidera les agriculteurs à produire des olives présentant une meilleure valeur organoleptique et de meilleurs bienfaits pour la santé.
« Nous voulons identifer les gènes responsables de la production de différents polyphénols et entre différentes variétés d’oliviers, et déterminer pourquoi certains fruits contiennent une plus grande quantité de ces molécules que d’autres », a déclaré Luque.