オリーブ品種の同定に関する新しい手法

ギリシャ・クレタ島のハニア地中海農業研究所（MAICh）園芸遺伝学・バイオテクノロジー学科でパナギオティス・カライツィス氏と共に研究を行うコンスタンティノス・ブラザキス氏によると、葉や果実の外観に基づいてオリーブの品種を同定する新しい半自動手法は、生産者向けのスマートフォンアプリの基盤となるほか、新たな国際的なオリーブの木データベースへの貢献も目的としている。

ブラザキス氏は、この新手法の応用例の一つとして、オリーブの実、葉、あるいは内果皮の写真から品種を特定できるスマートフォンアプリの登場を期待している。彼は今後1～2年以内にギリシャの品種から着手する予定であり、将来的には補足プロジェクトとして、このアプリに国際的な品種を追加するための支援を得られることを望んでいる。 同氏は、農家が自分が栽培している品種を確実に把握したいと考えているため、このスマートフォンアプリは、多様なオリーブ品種が存在する国々で最も役立つだろうと認めている。

ブラザキス氏のもう一つの目標は、世界中のオリーブ品種の外観や化学分析などの情報を網羅する、新しい国際的なオンラインデータベースの構築に貢献することだ。同氏によると、数カ国から15のパートナーが協力し、一般市民向けの使いやすいデータベースを準備中であり、これは「各品種の遺伝的、生理的、分子的、形態学的研究に基づいた」ものになるという。 研究者らは、過去に収集・再確認されたデータを組み込むとともに、新たな情報を追加する予定だ。

これは、広範かつ野心的な「Bioresources For Oliviculture（BeFOre）」プロジェクトの一環である。同プロジェクトは、欧州連合（EU）の研究・イノベーションプログラム「ホライズン2020」のマリー・スキロドフスカ・キュリー助成契約に基づき資金提供を受けており、国際オリーブ評議会からも支援を受けている。

BeFOreのウェブサイトによると、同プロジェクトは「分子、形態、生理学的レベルで植物の表現型を解析・特徴づけるための統合的な共通プロトコルの確立、および品種に関連するオリーブオイルの品質評価に焦点を当てており、オリーブ遺伝資源コレクション、リポジトリ、バンクを、変異性の主要な源および評価ツールとして活用し、オリーブ栽培の持続可能性を高め、既存および新たな課題に対処するための可能性を向上させることを目指している」としている。

豊富な遺伝資源とその特有の健康効果を保全するために、オリーブ種の多様性を評価・特徴づけることの重要性を強調するブラザキス氏は、オリーブ、オリーブの木、およびその葉の形態や構造、すなわち形態学に焦点を当てている。

10月中旬にクレタ島ハニアで開催された「第3回欧州園芸国際シンポジウム」において、ブラザキス氏は、イタリア国立研究評議会のルチアーナ・バルドーニ氏およびマリーナ・ブファッキ氏、モロッコのINRAマラケシュ所属のアブデルマジド・ムクリ氏、ならびにMAICh（国際地中海農業高等研究センターの一部）のパナギオティス・カライツィス氏との共同研究について発表した。

「形態学的パラメータを用いたオリーブ品種の特性化に向けた高度な数学的アルゴリズム」と題した発表の中で、ブラザキス氏は、自身の「研究は、様々なオリーブ栽培品種の『多様な形態学的パラメータを検出するための全く新しい半自動的手法』を提示することを目的としている」と説明した。彼の方法は以下の5つのステップからなる：

• 葉と果実のサンプルを採取する：品種が育苗場で特定された木の中央部から25～30個
• 画像データの作成：それらを撮影する
• セグメンテーション：科学用ソフトウェアを用いて、葉、オリーブの実、または種子の画像を背景から分離する
• 数学的アルゴリズムの適用：MATLABソフトウェアを使用し、オリーブや葉の形状・構造の様々な側面（例えば果実の場合、面積、周囲長、高さ、最大幅、最大幅の位置、対称性または非対称性、楕円形状、曲率、乳頭状突起など）に関連する一連の指示を作成する
• 結果の数値化：各オリーブ品種の形状と構造の各側面を記述する数値データを得る

ブラザキス氏は、自身のチームが取り組んでいる形態学的パラメータが異なる品種を区別できることを確認するために追加の試験を行う必要があると述べたが、成功すると確信している。また、彼が開発中の自動化ツールは、DNA分析よりも迅速かつ低コストでオリーブの品種を特定する方法を提供し、自身の木に関する情報を求める多くの農家にとって貴重な選択肢となるだろうと付け加えた。

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• オリーブ栽培のための生物資源（BeFOre）プロジェクトの概要


• 第3回欧州園芸国際シンポジウム – SHE2016