Des scientifiques espagnols font progresser la compréhension d'une maladie dévastatrice de l'olivier
Des chercheurs ont publié les résultats d'une étude menée sur 25 ans concernant le Colletotrichum, le champignon responsable de l'anthracnose.
Une équipe dirigée par des chercheurs du département d'agronomie de l'université de Cordoue a publié l'une des études les plus complètes à ce jour sur le Colletotrichum, le champignon responsable de l'anthracnose, également appelée « olive savonneuse ».
L'anthracnose de l'olivier est très virulente et peut entraîner des pertes de récolte pouvant atteindre 100 %. De plus, une toxine produite à l'intérieur du fruit pourri peut affaiblir les arbres eux-mêmes en provoquant le dépérissement des branches, réduisant ainsi les rendements futurs même après un traitement efficace. En Espagne, cette maladie est responsable d'une perte annuelle moyenne de 2,6 % des récoltes.
Dans le cas de Colletotrichum, les caractéristiques morphologiques ne nous permettent pas de différencier les différentes espèces ; nous devons donc recourir à des séquences d’ADN qui nous indiquent à quel point certains isolats sont similaires à d’autres
Dans le cadre de cette étude, 185 isolats au total, collectés sur une période de plus de deux décennies, ont été analysés. Les échantillons provenaient principalement d’Espagne et du Portugal, deux des plus grands pays producteurs d’huile d’olive au monde. Cependant, de nombreux autres échantillons ont été prélevés en Australie, au Brésil, en Californie, en Grèce, en Italie, en Tunisie et en Uruguay.
Voir aussi : Actualités de la recherche sur l'huile d'oliveBien qu’il existe de nombreuses recherches antérieures, l’identification moléculaire des isolats n’avait jamais été réalisée auparavant.
« Dans le cas de Colletotrichum, les caractéristiques morphologiques ne nous permettent pas de différencier les différentes espèces ; nous devons donc nous appuyer sur des séquences d'ADN qui nous indiquent le degré de similitude entre certains isolats », a déclaré Juan Moral, l'un des principaux chercheurs.
Après avoir utilisé sept régions génétiques spécifiques, 12 espèces distinctes de Colletotrichum ont été identifiées.
Des échantillons provenant d’autres cultures sensibles, telles que les amandes, les oranges douces et les fraises, ont également été inclus dans l’étude, et le champignon s’est révélé très adaptable et opportuniste.
Les isolats provenant d’échantillons d’olives australiennes ont montré de loin la plus grande diversité de Colletotrichum, mais les deux espèces dominantes en Espagne, au Portugal, en Grèce et en Italie étaient totalement absentes. Cela renforce l’hypothèse selon laquelle les espèces indigènes de Colletotrichum sont capables de passer rapidement à de nouveaux hôtes.
Cette capacité du champignon a des implications pratiques pour la prévention de la maladie, comme le démontre un cas de contamination croisée dans une pépinière du nord-est de l’Espagne où des agrumes hébergeant l’espèce C. fructicola sont soupçonnés d’avoir infecté des oliviers qui ont ensuite présenté une nécrose des feuilles, un symptôme rare mais potentiellement mortel de l’anthracnose.
Compte tenu de l’impact économique dévastateur de l’agent pathogène, diverses espèces ont été soumises à des fongicides à base de bénomyl et de cuivre afin de déterminer leur sensibilité et leur résistance.
« Nous avons constaté des différences de sensibilité aux fongicides entre les espèces et, lorsque nous avons inoculé différentes variétés, nous avons également observé des différences de virulence entre ces isolats », a déclaré Antonio Trapero, chercheur à l’université de Cordoue.
Les fongicides à base de cuivre sont devenus l’un des plus couramment utilisés ces dernières années, en partie en raison de leur coût moindre. Cependant, les résultats varient considérablement.
Par exemple, l’équipe a observé que, tandis que les isolats espagnols de C. godetiae provenant de régions oléicoles où les agriculteurs utilisent fréquemment des fongicides à base de cuivre étaient plus tolérants au cuivre que les isolats de C. nymphaeae, les échantillons provenant du Portugal ont montré des résultats contraires.
« Le fait de disposer d’isolats provenant de nombreux pays montre à quel point même les isolats d’une même espèce se comportent différemment selon la zone géographique d’où ils proviennent », a déclaré le chercheur Carlos Agustí.
L'université de Cordoue a déclaré qu'une étude aussi approfondie de la biologie et de la biodiversité des agents pathogènes responsables de l'anthracnose devrait contribuer à faire progresser la mise au point de méthodes de lutte plus efficaces.
Les gouvernements espagnol et andalou partagent cet objectif et ont tous deux apporté un financement important à cette recherche.