Des chercheurs identifient une nouvelle maladie affectant les oliveraies des Pouilles

De nouvelles recherches menées sur les oliviers du Salento ont mis en évidence la propagation d'un champignon déjà connu, dont l'action desséchante est bien plus rapide que celle de la bactérie Xylella.

De nouvelles recherches ont confirmé qu'une autre maladie se propage parmi les oliviers des Pouilles, parallèlement au syndrome de dépérissement rapide de l'olivier (OQDS) causé par Xylella fastidiosa pauca.

Les scientifiques ont déclaré que l'isolement de Neofusicoccum mediterraneum, un champignon qui se propage rapidement et endommage l'olivier, est significatif. Ce champignon pourrait également attaquer les arbres déjà infectés par Xylella fastidiosa.

Nous en sommes actuellement à la première phase de l'étude, et ce problème phytosanitaire doit encore être pleinement élucidé. Ensuite, sur la base des connaissances acquises, nous déterminerons comment gérer la maladie.– Massimo Pilotti, chercheur, CREA-DC

Selon l’étude intitulée « Neofusicoccum mediterraneum Is Involved in a Twig and Branch Dieback of Olive Trees Observed in Salento » (Neofusicoccum mediterraneum est impliqué dans le dépérissement des rameaux et des branches des oliviers observé dans le Salento) publiée dans Pathogens, les chercheurs ont acquis de nouvelles connaissances sur la manière de mieux lutter contre cette maladie. Cependant, de nombreuses questions restent encore sans réponse.

Massimo Pilotti, auteur correspondant de l’étude, du Centre de recherche pour la protection et la certification des végétaux (CREA-DC) à Rome, a déclaré que cette enquête « a été motivée par le fait qu’un phénomène de flétrissement, caractérisé par des symptômes inédits, était apparu dans les oliveraies depuis 2019 ».

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Il a souligné que « la découverte d’un nouveau syndrome de flétrissement dans les Pouilles ajoute une complexité supplémentaire à la situation phytosanitaire de la culture de l’olivier dans cette région ».

« Plusieurs questions se posent », a ajouté M. Pilotti. « Quel est l’impact du dépérissement des branches et des rameaux (BTD) sur la culture de l’olivier dans les Pouilles ? Combien de provinces sont réellement touchées ? Le BTD se propage-t-il activement ? Le BTD et l’OQDS se chevauchent-ils dans les mêmes oliveraies ? Et peuvent-ils être confondus l’un avec l’autre ? »

« À ce jour, presque toutes ces questions restent sans réponse, mais nous menons des enquêtes approfondies pour faire toute la lumière sur cette affaire », a-t-il poursuivi.

Pilotti a fait remarquer que « l’impact émotionnel de l’OQDS sur la culture de l’olivier dans les Pouilles, ainsi que la connaissance historique du flétrissement verticillien, une autre maladie de flétrissement bien connue de l’olivier, peuvent faire passer le BTD inaperçu. Il est donc nécessaire de révéler la nature de la maladie. »

Le chercheur a confirmé qu’il pouvait être difficile de distinguer correctement l’apparition du BTD et de l’OQDS.

« Les symptômes du BTD sont similaires à ceux de l’OQDS à première vue ou si le flétrissement dure depuis longtemps », a déclaré M. Pilotti. « En réalité, lorsque les symptômes apparaissent, le BTD et l’OQDS se distinguent par les taches nécrotiques rouge-bronze typiques du BTD qui apparaissent sur le limbe des feuilles, suivies d’un enroulement des feuilles vers le bas. »

« Il est certain qu’un diagnostic correct et définitif repose uniquement sur l’isolement de l’agent pathogène ou la détection moléculaire de celui-ci », a-t-il ajouté.

Le rôle de Neofusicoccum mediterraneum dans le BTD reste à évaluer.

« Ne commettons pas l’erreur fondamentale de considérer Neofusicoccum mediterraneum comme le seul agent responsable du BTD », a déclaré M. Pilotti. « Cela doit encore être pleinement démontré, bien que le champignon ait réagi de manière très agressive lors de nos tests de pathogénicité. »

Les chercheurs ont précisé que le champignon avait été détecté lors de la première enquête, « et sa présence est certainement une découverte pertinente, car il est bien connu dans d’autres pays (Espagne, États-Unis) comme l’agent principal de la BTD. »

« Cependant, dans ces pays, d’autres espèces fongiques ont été associées au BTD et se sont avérées contribuer au développement de la maladie », a déclaré Pilotti. « Nous devrons donc examiner un grand nombre d’échantillons provenant des différentes zones où le BTD est apparu afin de clarifier définitivement l’étiologie de la maladie et la mycobiote associée. » L’ensemble des champignons présents dans un habitat spécifique constitue la mycobiote.

Les chercheurs ont également noté que Neofusicoccum mediterraneum avait été signalé dans les oliveraies des Pouilles par d’autres chercheurs il y a 13 ans. Cependant, ces derniers n’avaient trouvé le champignon que sur les fruits et avec une fréquence minime.

Pilotti a émis l’hypothèse que le champignon « avait modifié sa relation avec l’hôte en raison de la sélection naturelle de nouvelles souches pathogènes ou avait simplement changé d’agressivité à la suite de modifications de la niche écologique des oliveraies ».

Le chercheur du CREA-DC a également expliqué comment ce champignon et d’autres champignons de la famille des Botryospaeriaceae peuvent infecter et endommager de nombreuses espèces agricoles pérennes et sauvages, chez lesquelles une phase latente alterne avec une virulence totale en fonction du degré de stress subi par l’hôte.

« Les principales espèces cultivées sensibles aux champignons de la famille des Botryospaeriaceae sont : la vigne, l'amandier, le pistachier, le noyer et les agrumes », a déclaré Pilotti.

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Les scientifiques ont également expliqué que le mode de développement de la BTD dans la région doit encore être évalué.

« En général, les espèces fongiques de la famille des Botryospaeriaceae infectent la plante hôte en pénétrant par les blessures causées par les outils de taille et les outils mécaniques de récolte entrant en contact avec la canopée, ce qui facilite également la propagation de l’inoculum au sein des vergers et entre eux », a déclaré M. Pilotti.

« Les gelées et les tempêtes de grêle constituent un autre mécanisme d’infection possible lié aux blessures », a-t-il ajouté. « De plus, en présence de blessures, la pluie ou toute projection d’eau joue un rôle dans la propagation de l’inoculum fongique et facilite l’accès aux points d’entrée. »

Compte tenu des progrès continus des recherches, les chercheurs ont souligné « à quel point il est crucial d’être conscient de la présence de cette maladie afin de ne pas la confondre avec l’OQDS ou la flétrissure verticillienne ».

« Nous avons enregistré des surinfections par les agents de l’OQDS et du BTD », a déclaré Pilotti. « Il est donc légitime de se demander si la présence d’une maladie conditionne la progression et la gravité de l’autre. »

Les chercheurs estiment qu’il est très important de distinguer les infections fongiques de celles causées par Xylella fastidiosa.

« Par exemple, lors des tests d’évaluation de l’efficacité des stratégies de lutte contre l’OQDS, il convient de s’assurer que les plantes traitées ne sont pas également affectées par la BTD », a déclaré M. Pilotti. « Si des phénomènes de flétrissement attribués à tort à Xylella fastidiosa continuent de se produire sur des arbres traités pour limiter l’OQDS, cela peut entraîner une mauvaise interprétation de l’efficacité réelle des interventions de lutte. »

« De plus, on ne peut pas s’attendre à ce qu’une stratégie de lutte efficace contre une maladie le soit également contre l’autre », a-t-il ajouté.

L’un des objectifs urgents de la recherche actuelle est de définir des mesures de confinement potentielles pour le champignon, car il est possible qu’il se propage et atteigne d’autres zones.

« Nous en sommes actuellement à la première phase de l’étude, et ce problème phytosanitaire doit encore être pleinement élucidé », a déclaré M. Pilotti. « Ensuite, sur la base des connaissances acquises, nous déterminerons comment gérer la maladie. »

« Il est important de noter qu’à ce jour, nous avons observé que les oliveraies qui n’ont pas été taillées récemment ne présentent pas de symptômes », a-t-il poursuivi. « Cela semble pertinent pour comprendre les modalités de propagation de la maladie et, par conséquent, si cela se confirme, pour mettre en place des mesures de confinement efficaces. »

Les chercheurs espèrent ensuite étendre l’échantillonnage à toutes les zones touchées, identifier les champignons associés, évaluer leur pathogénicité et identifier les facteurs épidémiologiques facilitant la propagation de la maladie.