Znanstvenici dekodiraju genom maslinovog drveta

Istraživači iz Centra za genomsku regulaciju (CRG), Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) i Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) dekodirali su genom stabla masline pomoću 1,300 godina starog uzorka koji pripada španjolskom Sorta Farga kao referenca.

Tijekom proteklih 10 godina, brojnim je biljnim vrstama genetski kod sastavljen, označen i javno dostupan. Sad se maslina može dodati na ovaj popis sekvenciranih biljnih genoma. Trogodišnji istraživački projekt financirala je španjolska banka Banco Santander, a objavljen 27. lipnja 2016. u GigaScience, časopisu s otvorenim podacima

Istraživačkim projektom koordinirao je Pablo Vargas, istraživač iz CSIC Real Jardín Botánico, koji je objasnio postupak u priopćenju:

"Postoje tri faze sekvenciranja genoma: prvo, izolirajte sve gene, koje smo objavili prije dvije godine. Drugo, okupite genom, što je stvar uređenja tih gena jedan za drugim, poput povezivanja labavih fraza u knjizi. Na kraju, identificirajte sve gene ili povezujte knjigu. Posljednje dvije faze su ono što smo učinili i sada predstavljamo. "

Tijekom postupka identifikacije gena maslinovog stabla, istraživači su otkrili da ono ima preko 56,000 - gena, mnogo više od ostalih biljnih vrsta, i dvostruko više od ljudskog genoma.

Istraživači su također otkrili da je korištenjem 1,300 godina starog uzorka masline ovo prvi put da je tako stara â € <"pojedinac ”imao je svoj genom sekvenciran. â € <"Do sada su sve jedinke sekvencirane, od voćne muhe (Drosophila melanogaster) do prvog analiziranog čovjeka, živjele određeno vrijeme, ovisno o njihovom ograničenom životnom vijeku. Ovo je prvi put da je DNK osobe starije od 1,000 godina, a koja će vjerojatno živjeti još 1,300 godina, sekvencirana ”, otkrili su istraživači Pablo Vargas i Toni Gabaldón (CRG).

Razumijevanje genetskog koda stabla masline pomoći će znanstvenicima da razumiju razne čimbenike povezane sa stablom, uključujući njegovu dugovječnost, prilagodljivost sušnim uvjetima i razlike između sorti, veličina i okusa maslina. U konačnici, ovo će također olakšati nova istraživanja genetskog poboljšanja u proizvodnji maslina i maslinovog ulja te kako zaštititi maslinovo stablo od bakterija i infekcija.

Kako bi se olakšala daljnja istraživanja, cjelovito sekvenciranje genoma masline dostupno je u javnoj domeni na GigaScience GigaDB baza podataka.

• GigaScience


• Giga baza podataka