Znanstvenici dešifrirali genom masline
Tim znanstvenika iz Španjolske po prvi put je objavio potpuni genom masline.
Istraživači iz Centra za genomsku regulaciju (CRG), Kraljevskog botaničkog vrta (CSIC-RJB) i Nacionalnog centra za genomsku analizu (CNAG-CRG) dešifrirali su genom masline koristeći kao referencu 1.300 godina staru jedinku španjolske sorte Farga.
Tijekom posljednjih 10 godina genetski je kod niza biljnih vrsta sastavljen, anotiran i učinjen javno dostupnim. Sada se na taj popis sekvenciranih biljnih genoma može dodati i maslina. Troogodišnji istraživački projekt financirala je španjolska banka Banco Santander, a objavljen je 27. lipnja 2016. u časopisu GigaScience, časopisu otvorenih podataka.
Istraživački projekt koordinirao je Pablo Vargas, istraživač iz CSIC Real Jardín Botánico, koji je proces objasnio u priopćenju za medije:
"Sekvenciranje genoma ima tri faze: prva je izolacija svih gena, o čemu smo objavili prije dvije godine. Druga je faza sastavljanje genoma, što znači poredanje tih gena jedan za drugim, poput povezivanja odvojenih rečenica u knjizi. Posljednja je faza identifikacija svih gena, odnosno 'vezanje knjige'. Te dvije posljednje faze smo proveli i sada ih predstavljamo."
Pablo Vargas (CSIC)
Tijekom procesa identifikacije gena masline, istraživači su otkrili da ona ima više od 56.000 gena, što je mnogo više nego kod drugih biljnih vrsta, i dvostruko više nego kod ljudskog genoma.
Istraživači su također otkrili da je, koristeći uzorak stogodišnjeg maslinovog stabla, ovo prvi put da je genom takvog starog "jedinca" sekvenciran. "Do sada su svi sekvencirani jedinci, od voćne mušice (Drosophila melanogaster) do prvog analiziranog ljudskog bića, živjeli određeno vrijeme, ovisno o svom ograničenom životnom vijeku. Ovo je prvi put da je sekvenciran DNK pojedinca starijeg od 1.000 godina, koji će vjerojatno živjeti još 1.300 godina", otkrili su istraživači Pablo Vargas i Toni Gabaldón (CRG).
Razumijevanje genetskog koda masline pomoći će znanstvenicima da razumiju razne čimbenike povezane s drvetom, uključujući njegovu dugovječnost, prilagodljivost sušnim uvjetima te razlike između sorti, veličina i okusa maslina. U konačnici, to će također olakšati nova istraživanja u području genetskog unapređenja za proizvodnju maslina i maslinovog ulja te načina zaštite masline od bakterija i infekcija.
Kako bi se olakšala daljnja istraživanja, potpuno sekvenciranje genoma masline učinjeno je dostupnim javnosti na bazi podataka GigaScience GigaDB.