Bilim insanları zeytin ağacının genomunu çözdü
İspanya'dan bir bilim insanı ekibi, zeytin ağacının tam genomunu ilk kez yayınladı.
Genomik Düzenleme Merkezi (CRG), Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) ve Ulusal Genom Analizi Merkezi (CNAG-CRG) araştırmacıları, İspanyol Farga çeşidine ait 1.300 yıllık bir örneği referans alarak zeytin ağacının genomunu deşifre etti.
Son 10 yılda, birçok bitki türünün genetik kodu birleştirildi, açıklamaları eklendi ve kamuya açık hale getirildi. Artık zeytin ağacı da dizilenmiş bitki genomları listesine eklenebilir. Üç yıllık araştırma projesi, İspanyol bankası Banco Santander tarafından finanse edildi ve 27 Haziran 2016'da açık veri dergisi GigaScience'da yayınlandı.
Araştırma projesi, CSIC Real Jardín Botánico'dan araştırmacı Pablo Vargas tarafından koordine edildi. Vargas, bir basın bülteninde süreci şöyle açıkladı:
“Genom dizilemesi üç aşamadan oluşur: ilk olarak, iki yıl önce yayınladığımız tüm genleri izole etmek. İkinci olarak, bir kitapta dağınık cümleleri birbirine bağlamak gibi, bu genleri arka arkaya sıralayarak genomu birleştirmek. Son olarak, tüm genleri tanımlamak, yani kitabı ciltlemek. Son iki aşamayı tamamladık ve şimdi sonuçları sunuyoruz.”
Pablo Vargas (CSIC)
Zeytin ağacının genlerini tanımlama sürecinde araştırmacılar, ağacın 56.000'den fazla geni olduğunu keşfettiler; bu sayı diğer bitki türlerinden çok daha fazla ve insan genomunun iki katıdır.
Araştırmacılar ayrıca, 1.300 yıllık bir zeytin ağacı örneğini kullanarak, bu kadar eski bir “bireyin” genomunun diziliminin ilk kez yapıldığını ortaya koydu. “Şimdiye kadar, meyve sineğinden (Drosophila melanogaster) analiz edilen ilk insana kadar dizilimi yapılan tüm bireyler, sınırlı yaşam sürelerine bağlı olarak belirli bir süre yaşamışlardır. 1.000 yaşın üzerinde olan ve muhtemelen 1.300 yıl daha yaşayacak bir bireyin DNA'sının dizilendiği ilk kez oluyor," diye açıkladı araştırmacılar Pablo Vargas ve Toni Gabaldón (CRG).
Zeytin ağacının genetik kodunu anlamak, bilim insanlarının ağacın uzun ömürlülüğü, kurak koşullara uyum sağlama yeteneği ve zeytin çeşitleri, boyutları ve lezzetleri arasındaki farklar dahil olmak üzere ağaçla ilgili çeşitli faktörleri anlamalarına yardımcı olacaktır. Sonuçta bu, zeytin ve zeytinyağı üretimi için genetik iyileştirme ve zeytin ağacını bakterilerden ve enfeksiyonlardan koruma yöntemleri konusunda yeni araştırmaları da kolaylaştıracaktır.
Daha ileri araştırmaları kolaylaştırmak amacıyla, zeytin ağacı genomunun tam dizilimi GigaScience GigaDB veritabanında kamuoyuna açık hale getirildi.