Οι επιστήμονες αποκωδικοποιούν το γονιδίωμα της ελιάς

Μια ομάδα επιστημόνων από την Ισπανία έχουν δημοσιεύσει για πρώτη φορά το πλήρες γονιδίωμα της ελιάς.

Ιούνιος 30, 2016
Από την Ίσαμπέλ Πούτινγια

Πρόσφατες Ειδήσεις

Οι ερευνητές του Κέντρου Γονιδιωματικής Ρύθμισης (CRG), του Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) και του Centro Nacional de Anális Genomico (CNAG-CRG) αποκωδικοποίησαν το γονιδίωμα της ελιάς χρησιμοποιώντας ένα δείγμα 1,300 ηλικίας ετών που ανήκει στα ισπανικά Ποικιλία Farga ως αναφορά.

Τα τελευταία δέκα χρόνια, ορισμένα είδη φυτών έχουν συναρμολογηθεί, σχολιασθεί και δημοσιοποιηθεί. Τώρα, το ελαιόδενδρο μπορεί να προστεθεί σε αυτόν τον κατάλογο γονιδιωμάτων φυτών που έχουν αναλυθεί. Το τριετές ερευνητικό πρόγραμμα χρηματοδοτήθηκε από την ισπανική τράπεζα Banco Santander και δημοσιεύθηκε στις 10 Ιουνίου 27 στο GigaScience, ένα περιοδικό ανοικτών δεδομένων

Το ερευνητικό έργο συντονίστηκε από τον Pablo Vargas, ερευνητή του CSIC Real Jardín Botánico, ο οποίος εξήγησε τη διαδικασία σε ένα δελτίο τύπου:

"Υπάρχουν τρεις φάσεις στην αλληλούχιση γονιδιώματος: πρώτα, απομονώστε όλα τα γονίδια, τα οποία δημοσιεύσαμε πριν από δύο χρόνια. Δεύτερον, συναρμολογήστε το γονιδίωμα, το οποίο είναι θέμα διατάξεως των γονιδίων το ένα μετά το άλλο, όπως η σύνδεση των χαλαρών φράσεων σε ένα βιβλίο. Τέλος, προσδιορίστε όλα τα γονίδια ή δεσμεύστε το βιβλίο. Οι τελευταίες δύο φάσεις είναι αυτό που κάναμε και τώρα παρουσιάζουμε. "

Ο Pablo Vargas (CSIC)

Κατά τη διάρκεια της διαδικασίας ταυτοποίησης των γονιδίων της ελιάς, οι ερευνητές ανακάλυψαν ότι είχε πάνω από τα γονίδια 56,000, πολύ περισσότερο από άλλα φυτικά είδη, και διπλασιάστηκε από αυτά του ανθρώπινου γονιδιώματος.

Διαφήμιση

Οι ερευνητές αποκάλυψαν επίσης ότι χρησιμοποιώντας ένα δείγμα ελιάς ηλικίας 1,300 ετών, αυτή ήταν η πρώτη φορά που μια τέτοια παλιά "μεμονωμένο "έχει προσδιορίσει την αλληλουχία του γονιδιώματός του. "Μέχρι τώρα, όλα τα άτομα που έχουν αναλυθεί, από τη μύγα καρπών (Drosophila melanogaster) έως τον πρώτο άνθρωπο που αναλύθηκε, έζησαν για κάποιο χρονικό διάστημα, ανάλογα με το περιορισμένο προσδόκιμο ζωής τους. Αυτή είναι η πρώτη φορά που το DNA ενός ατόμου ηλικίας άνω των 1,000 ετών, το οποίο πιθανότατα θα ζήσει άλλα 1,300 χρόνια, έχει αναλυθεί ", ανέφεραν οι ερευνητές Pablo Vargas και Toni Gabaldón (CRG).

Η κατανόηση του γενετικού κώδικα της ελιάς θα βοηθήσει τους επιστήμονες να κατανοήσουν διάφορους παράγοντες που σχετίζονται με το δέντρο, συμπεριλαμβανομένης της μακροζωίας, της προσαρμοστικότητας στις άγονες συνθήκες και των διαφορών μεταξύ των ποικιλιών, των μεγεθών και της γεύσης των ελιών. Τελικά, αυτό θα διευκολύνει επίσης τη νέα έρευνα γενετικής βελτίωσης για την παραγωγή ελιών και ελαιολάδου και τον τρόπο προστασίας της ελιάς από βακτήρια και λοιμώξεις.

Προκειμένου να διευκολυνθεί η περαιτέρω έρευνα, ο πλήρης προσδιορισμός της αλληλουχίας του γονιδιώματος της ελιάς δόθηκε στη διάθεση του κοινού στο GigaScience Βάση δεδομένων GigaDB.


Σχετικές ειδήσεις