Επιστήμονες αποκωδικοποιούν το γονιδίωμα της ελιάς
Μια ομάδα επιστημόνων από την Ισπανία δημοσίευσε για πρώτη φορά το πλήρες γονιδίωμα της ελιάς.
Ερευνητές από το Κέντρο Γενωμικής Ρύθμισης (CRG), τον Βασιλικό Βοτανικό Κήπο (CSIC-RJB) και το Εθνικό Κέντρο Γενωμικής Ανάλυσης (CNAG-CRG) αποκωδικοποίησαν το γονιδίωμα της ελιάς χρησιμοποιώντας ως σημείο αναφοράς ένα δείγμα ηλικίας 1.300 ετών που ανήκει στην ισπανική ποικιλία Farga.
Τα τελευταία 10 χρόνια, ο γενετικός κώδικας πολλών φυτικών ειδών έχει συναρμολογηθεί, σχολιαστεί και δημοσιοποιηθεί. Τώρα η ελιά μπορεί να προστεθεί σε αυτόν τον κατάλογο των αλληλουχιών γονιδιωμάτων φυτών. Το τριετές ερευνητικό πρόγραμμα χρηματοδοτήθηκε από την ισπανική τράπεζα Banco Santander και δημοσιεύθηκε στις 27 Ιουνίου 2016 στο GigaScience, ένα περιοδικό ανοικτών δεδομένων
Το ερευνητικό πρόγραμμα συντονίστηκε από τον Pablo Vargas, ερευνητή του CSIC Real Jardín Botánico, ο οποίος εξήγησε τη διαδικασία σε ένα δελτίο τύπου:
«Η αλληλούχιση του γονιδιώματος περιλαμβάνει τρεις φάσεις: πρώτον, την απομόνωση όλων των γονιδίων, την οποία δημοσιεύσαμε πριν από δύο χρόνια. Δεύτερον, τη συναρμολόγηση του γονιδιώματος, η οποία συνίσταται στην ταξινόμηση αυτών των γονιδίων το ένα μετά το άλλο, όπως η σύνδεση χαλαρών φράσεων σε ένα βιβλίο. Τέλος, την ταυτοποίηση όλων των γονιδίων, ή τη σύνδεση του βιβλίου. Οι δύο τελευταίες φάσεις είναι αυτές που έχουμε ολοκληρώσει και παρουσιάζουμε τώρα».
Pablo Vargas (CSIC)
Κατά τη διαδικασία ταυτοποίησης των γονιδίων της ελιάς, οι ερευνητές ανακάλυψαν ότι διαθέτει πάνω από 56.000 γονίδια, πολύ περισσότερα από άλλα φυτικά είδη και διπλάσια από το ανθρώπινο γονιδίωμα.
Οι ερευνητές αποκάλυψαν επίσης ότι, χρησιμοποιώντας ένα δείγμα ελιάς ηλικίας 1.300 ετών, αυτή ήταν η πρώτη φορά που το γονιδίωμα ενός τόσο παλιού «ατόμου» αλληλουχήθηκε. «Μέχρι τώρα, όλα τα άτομα που έχουν αλληλουχηθεί, από τη μύγα του φρούτου (Drosophila melanogaster) έως τον πρώτο άνθρωπο που αναλύθηκε, έχουν ζήσει για ένα ορισμένο χρονικό διάστημα, ανάλογα με το περιορισμένο προσδόκιμο ζωής τους. Αυτή είναι η πρώτη φορά που έχει αλληλουχηθεί το DNA ενός ατόμου ηλικίας άνω των 1.000 ετών, το οποίο πιθανότατα θα ζήσει άλλα 1.300 χρόνια», αποκάλυψαν οι ερευνητές Pablo Vargas και Toni Gabaldón (CRG).
Η κατανόηση του γενετικού κώδικα της ελιάς θα βοηθήσει τους επιστήμονες να κατανοήσουν μια ποικιλία παραγόντων που σχετίζονται με το δέντρο, συμπεριλαμβανομένης της μακροζωίας του, της προσαρμοστικότητάς του σε ξηρές συνθήκες, καθώς και των διαφορών μεταξύ των ποικιλιών, των μεγεθών και της γεύσης των ελιών. Τελικά, αυτό θα διευκολύνει επίσης νέες έρευνες σχετικά με τη γενετική βελτίωση για την παραγωγή ελιών και ελαιολάδου, καθώς και για τον τρόπο προστασίας της ελιάς από βακτήρια και λοιμώξεις.
Προκειμένου να διευκολυνθεί η περαιτέρω έρευνα, η πλήρης αλληλουχία του γονιδιώματος της ελιάς έχει καταστεί διαθέσιμη στο κοινό μέσω της βάσης δεδομένων GigaScience GigaDB.