Οι επιστήμονες αποκωδικοποιούν το γονιδίωμα της ελιάς

Ερευνητές από το Κέντρο Γονιδιωματικής Ρύθμισης (CRG), το Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) και το Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) αποκωδικοποίησαν το γονιδίωμα της ελιάς χρησιμοποιώντας ένα δείγμα 1,300 ετών που ανήκε στην Ισπανία Η ποικιλία Farga ως αναφορά.

Κατά τα τελευταία 10 χρόνια, ορισμένα είδη φυτών έχουν συγκεντρώσει, σχολιάσει και δημοσιοποιήσει τον γενετικό τους κώδικα. Τώρα η ελιά μπορεί να προστεθεί σε αυτόν τον κατάλογο ακολουθιών γονιδιώματος φυτών. Το τριετές ερευνητικό έργο χρηματοδοτήθηκε από την ισπανική τράπεζα, Banco Santander, και δημοσιεύθηκε στις 27 Ιουνίου 2016 στο GigaScience, ένα περιοδικό ανοιχτών δεδομένων

Το ερευνητικό έργο συντονίστηκε από τον Pablo Vargas, έναν ερευνητή από το CSIC Real Jardín Botánico, ο οποίος εξήγησε τη διαδικασία σε ένα δελτίο τύπου:

"Υπάρχουν τρεις φάσεις της αλληλουχίας του γονιδιώματος: πρώτον, απομόνωση όλων των γονιδίων, τα οποία δημοσιεύσαμε πριν από δύο χρόνια. Δεύτερον, συναρμολογήστε το γονιδίωμα, το οποίο είναι θέμα παραγγελίας αυτών των γονιδίων το ένα μετά το άλλο, όπως η σύνδεση χαλαρών φράσεων σε ένα βιβλίο. Τέλος, εντοπίστε όλα τα γονίδια ή δεσμεύστε το βιβλίο. Οι δύο τελευταίες φάσεις είναι αυτό που κάναμε και παρουσιάζουμε τώρα. "

Κατά τη διάρκεια της διαδικασίας ταυτοποίησης των γονιδίων της ελιάς, οι ερευνητές ανακάλυψαν ότι είχε πάνω από τα γονίδια 56,000, πολύ περισσότερο από άλλα φυτικά είδη, και διπλασιάστηκε από αυτά του ανθρώπινου γονιδιώματος.

Οι ερευνητές αποκάλυψαν επίσης ότι χρησιμοποιώντας ένα δείγμα ελιάς 1,300 ετών, αυτή ήταν η πρώτη φορά που τόσο παλιά ​"μεμονωμένο "έχει προσδιορίσει την αλληλουχία του γονιδιώματός του. ​"Μέχρι τώρα, όλα τα άτομα που αλληλουχήθηκαν, από τη μύγα φρούτων (Drosophila melanogaster) έως τον πρώτο άνθρωπο που αναλύθηκε, έχουν ζήσει για ένα ορισμένο χρονικό διάστημα, ανάλογα με το περιορισμένο προσδόκιμο ζωής τους. Είναι η πρώτη φορά που το DNA ενός ατόμου ηλικίας άνω των 1,000 ετών, και πιθανότατα θα ζήσει άλλα 1,300 χρόνια, έχει αλληλουχηθεί », αποκάλυψαν οι ερευνητές Pablo Vargas και Toni Gabaldón (CRG).

Η κατανόηση του γενετικού κώδικα της ελιάς θα βοηθήσει τους επιστήμονες να κατανοήσουν μια ποικιλία παραγόντων που σχετίζονται με το δέντρο, συμπεριλαμβανομένης της μακροζωίας του, της προσαρμοστικότητάς του σε ξηρές συνθήκες και των διαφορών μεταξύ των ποικιλιών, των μεγεθών και της γεύσης των ελιών. Τελικά, αυτό θα διευκολύνει επίσης τη νέα έρευνα για τη γενετική βελτίωση για την παραγωγή ελιών και ελαιολάδου και πώς να προστατεύει την ελιά από βακτήρια και λοιμώξεις.

Προκειμένου να διευκολυνθεί η περαιτέρω έρευνα, ο πλήρης προσδιορισμός της αλληλουχίας του γονιδιώματος της ελιάς δόθηκε στη διάθεση του κοινού στο GigaScience Βάση δεδομένων GigaDB.

• GigaScience


• Βάση δεδομένων Giga